Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD247P20963 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD247P20963 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD247P20963 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD247P20963 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD247P20963 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD247P20963 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD247P20963 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD247P20963 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CD247P20963 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD247P20963 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD247P20963 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD247P20963 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD247P20963 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD247P20963 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD247P20963 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD247P20963 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD247P20963 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD247P20963 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD247P20963 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD247P20963 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CD247P20963 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD247P20963 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD247P20963 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD247P20963 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD247P20963 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD247P20963 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD247P20963 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD247P20963 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD247P20963 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD247P20963 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD247P20963 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD247P20963 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CD247P20963 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD247P20963 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD247P20963 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD247P20963 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD247P20963 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CD247P20963 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD247P20963 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD247P20963 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CD247P20963 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD247P20963 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD247P20963 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD247P20963 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD247P20963 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD247P20963 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms