Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB3P16520 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB3P16520 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB3P16520 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB3P16520 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GNB3P16520 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GNB3P16520 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GNB3P16520 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB3P16520 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms