Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FDPSP14324 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FDPSP14324 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FDPSP14324 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FDPSP14324 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FDPSP14324 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FDPSP14324 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FDPSP14324 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FDPSP14324 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDPSP14324 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDPSP14324 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDPSP14324 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDPSP14324 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDPSP14324 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDPSP14324 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDPSP14324 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDPSP14324 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDPSP14324 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDPSP14324 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDPSP14324 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDPSP14324 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDPSP14324 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FDPSP14324 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDPSP14324 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDPSP14324 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDPSP14324 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDPSP14324 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FDPSP14324 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDPSP14324 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDPSP14324 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDPSP14324 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDPSP14324 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDPSP14324 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDPSP14324 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDPSP14324 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDPSP14324 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDPSP14324 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FDPSP14324 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FDPSP14324 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FDPSP14324 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms