Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT13P13646 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT13P13646 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT13P13646 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT13P13646 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT13P13646 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT13P13646 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT13P13646 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT13P13646 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT13P13646 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT13P13646 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT13P13646 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT13P13646 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT13P13646 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT13P13646 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT13P13646 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT13P13646 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT13P13646 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT13P13646 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT13P13646 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT13P13646 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT13P13646 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT13P13646 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT13P13646 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT13P13646 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT13P13646 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT13P13646 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT13P13646 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms