Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKBP12277 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKBP12277 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKBP12277 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CKBP12277 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKBP12277 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKBP12277 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKBP12277 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKBP12277 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKBP12277 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKBP12277 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKBP12277 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKBP12277 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKBP12277 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKBP12277 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKBP12277 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKBP12277 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKBP12277 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CKBP12277 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CKBP12277 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKBP12277 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKBP12277 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKBP12277 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKBP12277 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKBP12277 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CKBP12277 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CKBP12277 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKBP12277 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKBP12277 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKBP12277 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKBP12277 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CKBP12277 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKBP12277 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKBP12277 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKBP12277 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKBP12277 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms