Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMIGD3P0DMS9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMIGD3P0DMS9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms