Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RGPD1P0DJD0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGPD1P0DJD0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms