Protein–RNA interactions for Protein: P0C8F1

PATE4, Prostate and testis expressed protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE4P0C8F1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PATE4P0C8F1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms