Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB5P09067 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB5P09067 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms