Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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PKHD1P08F94 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PKHD1P08F94 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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PKHD1P08F94 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PKHD1P08F94 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PKHD1P08F94 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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