Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM2P07951 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM2P07951 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM2P07951 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPM2P07951 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM2P07951 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM2P07951 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM2P07951 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM2P07951 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM2P07951 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM2P07951 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM2P07951 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM2P07951 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM2P07951 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM2P07951 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM2P07951 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM2P07951 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM2P07951 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM2P07951 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM2P07951 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM2P07951 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM2P07951 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM2P07951 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM2P07951 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM2P07951 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM2P07951 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM2P07951 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM2P07951 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM2P07951 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM2P07951 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM2P07951 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM2P07951 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM2P07951 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM2P07951 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM2P07951 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM2P07951 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM2P07951 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM2P07951 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM2P07951 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM2P07951 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM2P07951 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM2P07951 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM2P07951 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM2P07951 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM2P07951 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM2P07951 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM2P07951 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM2P07951 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms