Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX58O95786 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX58O95786 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX58O95786 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX58O95786 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX58O95786 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX58O95786 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX58O95786 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX58O95786 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX58O95786 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX58O95786 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX58O95786 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX58O95786 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX58O95786 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX58O95786 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX58O95786 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX58O95786 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX58O95786 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX58O95786 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX58O95786 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX58O95786 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX58O95786 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX58O95786 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX58O95786 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DDX58O95786 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX58O95786 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX58O95786 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX58O95786 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX58O95786 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX58O95786 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX58O95786 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX58O95786 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX58O95786 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX58O95786 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX58O95786 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX58O95786 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX58O95786 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX58O95786 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX58O95786 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX58O95786 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX58O95786 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX58O95786 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX58O95786 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX58O95786 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX58O95786 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX58O95786 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX58O95786 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX58O95786 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX58O95786 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX58O95786 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX58O95786 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX58O95786 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX58O95786 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX58O95786 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX58O95786 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX58O95786 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX58O95786 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX58O95786 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms