Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA2O43921 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms