Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MEFVO15553 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEFVO15553 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEFVO15553 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEFVO15553 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEFVO15553 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEFVO15553 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEFVO15553 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEFVO15553 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEFVO15553 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEFVO15553 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MEFVO15553 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEFVO15553 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MEFVO15553 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEFVO15553 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEFVO15553 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEFVO15553 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MEFVO15553 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEFVO15553 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEFVO15553 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEFVO15553 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEFVO15553 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEFVO15553 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEFVO15553 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEFVO15553 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEFVO15553 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEFVO15553 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEFVO15553 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEFVO15553 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEFVO15553 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEFVO15553 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEFVO15553 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEFVO15553 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEFVO15553 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEFVO15553 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEFVO15553 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEFVO15553 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEFVO15553 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms