Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CEP290O15078 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP290O15078 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP290O15078 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP290O15078 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP290O15078 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP290O15078 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP290O15078 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP290O15078 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP290O15078 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP290O15078 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP290O15078 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP290O15078 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP290O15078 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP290O15078 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CEP290O15078 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP290O15078 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP290O15078 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP290O15078 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP290O15078 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP290O15078 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP290O15078 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP290O15078 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP290O15078 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP290O15078 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP290O15078 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP290O15078 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP290O15078 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP290O15078 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP290O15078 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP290O15078 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CEP290O15078 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP290O15078 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP290O15078 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP290O15078 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP290O15078 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP290O15078 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP290O15078 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP290O15078 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP290O15078 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP290O15078 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP290O15078 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP290O15078 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP290O15078 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CEP290O15078 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CEP290O15078 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CEP290O15078 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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