Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC27A2O14975 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC27A2O14975 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms