Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTDSP2O14595 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTDSP2O14595 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms