Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBXN8O00124 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN8O00124 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms