Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCER2I3L3R5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCER2I3L3R5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms