Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CCDC179H3BU77 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms