Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMX2-CTNND1H3BSU7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms