Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00587B1AMM8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00587B1AMM8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms