Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GMNCA6NCL1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms