Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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