Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KPTNQ9Y664 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KPTNQ9Y664 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms