Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E2

PCDHB7, Protocadherin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB7Q9Y5E2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCDHB7Q9Y5E2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB7Q9Y5E2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms