Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q5

LAMTOR2, Ragulator complex protein LAMTOR2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR2Q9Y2Q5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LAMTOR2Q9Y2Q5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms