Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC12A4Q9UP95 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC12A4Q9UP95 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms