Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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