Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms