Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COPG2Q9UBF2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COPG2Q9UBF2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms