Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ0

DNAJC27, DnaJ homolog subfamily C member 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC27Q9NZQ0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DNAJC27Q9NZQ0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DNAJC27Q9NZQ0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms