Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A4Q9NY91 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A4Q9NY91 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A4Q9NY91 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A4Q9NY91 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A4Q9NY91 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A4Q9NY91 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A4Q9NY91 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A4Q9NY91 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A4Q9NY91 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A4Q9NY91 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A4Q9NY91 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A4Q9NY91 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A4Q9NY91 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A4Q9NY91 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms