Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CWC25Q9NXE8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms