Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMBRD1Q9NUN5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms