Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TOPORSQ9NS56 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOPORSQ9NS56 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms