Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CYTL1Q9NRR1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms