Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPRD1BQ9NQG5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms