Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VCX3AQ9NNX9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms