Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUFT1Q9NNX1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms