Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SLIRPQ9GZT3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLIRPQ9GZT3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms