Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BCL11BQ9C0K0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BCL11BQ9C0K0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BCL11BQ9C0K0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms