Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HDAC8Q9BY41 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC8Q9BY41 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms