Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PBDC1Q9BVG4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PBDC1Q9BVG4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBDC1Q9BVG4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PBDC1Q9BVG4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms