Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SEC22CQ9BRL7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC22CQ9BRL7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms