Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms