Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUFY1Q96T51 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY1Q96T51 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms