Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRAMP1Q96RY5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms