Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms