Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q96MF0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q96MF0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q96MF0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q96MF0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q96MF0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q96MF0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms